MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0114.4 HNF4A letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 46504 E= 0 0.216024 0.153449 0.299007 0.331520 0.210477 0.310403 0.199854 0.279266 0.031567 0.891171 0.026600 0.050662 0.931554 0.027030 0.022815 0.018601 0.864807 0.029460 0.077735 0.027998 0.930329 0.011698 0.040792 0.017181 0.015397 0.019697 0.936006 0.028901 0.019934 0.014945 0.046964 0.918158 0.059565 0.812919 0.039265 0.088250 0.029309 0.910481 0.013827 0.046383 0.788190 0.059823 0.063134 0.088853 0.291889 0.212089 0.279847 0.216175 0.328552 0.195037 0.251892 0.224518 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0114.4 MOTIF MA0484.1 HNF4G letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 9452 E= 0 0.371773 0.197207 0.212759 0.218261 0.344795 0.161976 0.405205 0.088024 0.496826 0.010791 0.403195 0.089187 0.116695 0.021265 0.791367 0.070673 0.205671 0.075434 0.349238 0.369657 0.159860 0.303639 0.241113 0.295387 0.000000 0.933876 0.023381 0.042742 0.988468 0.005819 0.005713 0.000000 0.834638 0.008675 0.156686 0.000000 0.895472 0.000000 0.099238 0.005290 0.010474 0.000635 0.962548 0.026344 0.034278 0.015129 0.383411 0.567182 0.023804 0.458950 0.117118 0.400127 0.016822 0.886267 0.008993 0.087918 0.717837 0.084003 0.058824 0.139336 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0484.1 MOTIF MA0484.2 HNF4G letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18222 E= 0 0.210899 0.152892 0.305126 0.331083 0.200582 0.310614 0.209637 0.279168 0.023817 0.904840 0.022994 0.048348 0.933542 0.024641 0.025025 0.016793 0.861815 0.027824 0.086489 0.023872 0.930908 0.009439 0.042202 0.017451 0.011415 0.018055 0.944737 0.025793 0.015201 0.012457 0.046153 0.926188 0.061354 0.818626 0.038250 0.081769 0.030952 0.905224 0.012403 0.051421 0.771211 0.065306 0.071287 0.092196 0.274833 0.223521 0.292284 0.209362 0.318955 0.204039 0.255845 0.221161 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0484.2 MOTIF MA1495.1 HOXA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 7406 E= 0 0.157575 0.302998 0.360113 0.179314 0.000000 0.172699 0.000000 0.827301 0.690021 0.194074 0.115904 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.119297 0.206265 0.674438 0.824538 0.000000 0.175462 0.000000 0.158677 0.379608 0.302093 0.159622 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1495.1 MOTIF MA0899.1 HOXA10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 8382 E= 0 0.276187 0.169769 0.357075 0.196970 0.174410 0.126367 0.602776 0.096447 0.017803 0.449965 0.006865 0.525367 0.563391 0.303576 0.068701 0.064332 0.853375 0.046329 0.073109 0.027187 0.041900 0.001256 0.000000 0.956844 0.694072 0.009782 0.014091 0.282054 0.944125 0.004055 0.008561 0.043258 0.891122 0.060393 0.013291 0.035194 0.595199 0.147859 0.110788 0.146154 0.359981 0.249254 0.146761 0.244004 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0899.1 MOTIF MA0650.1 HOXA13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 384 E= 0 0.161458 0.643229 0.184896 0.010417 0.002625 0.648294 0.020997 0.328084 0.669377 0.189702 0.024390 0.116531 0.888489 0.000000 0.000000 0.111511 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.894928 0.032609 0.018116 0.054348 0.939163 0.000000 0.000000 0.060837 0.988000 0.012000 0.000000 0.000000 0.641558 0.155844 0.114286 0.088312 0.421053 0.291498 0.093117 0.194332 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0650.1 MOTIF MA0650.2 HOXA13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 953 E= 0 0.308499 0.368311 0.304302 0.018888 0.049567 0.750590 0.199843 0.000000 0.000000 0.946429 0.000000 0.053571 0.707715 0.292285 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.982492 0.000000 0.017508 0.000000 0.998953 0.000000 0.001047 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.724374 0.186029 0.027335 0.062263 0.156800 0.606400 0.081600 0.155200 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0650.2 MOTIF MA0900.1 HOXA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 8986 E= 0 0.244380 0.291453 0.263744 0.200423 0.175161 0.377699 0.296350 0.150790 0.087082 0.265667 0.049308 0.597943 0.595265 0.317854 0.066152 0.020730 0.911165 0.034885 0.049792 0.004158 0.000000 0.000000 0.000667 0.999333 0.015491 0.119985 0.000000 0.864524 0.947085 0.014230 0.003268 0.035417 0.243517 0.317084 0.316082 0.123317 0.182506 0.421322 0.227020 0.169152 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0900.1 MOTIF MA0900.2 HOXA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 56949 E= 0 0.155929 0.341569 0.398356 0.104146 0.000000 0.060015 0.000000 0.939985 0.693129 0.301805 0.005066 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.965221 0.000000 0.034779 0.000000 0.186855 0.286753 0.390637 0.135755 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0900.2 MOTIF UN0558.1 HOXA3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2540 E= 0 0.298031 0.187402 0.349213 0.165354 0.033562 0.449657 0.466979 0.049802 0.000000 0.165023 0.000000 0.834977 0.711086 0.286114 0.002800 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.169120 0.830880 0.875560 0.000000 0.124440 0.000000 0.338189 0.209055 0.242913 0.209843 0.133465 0.383858 0.266142 0.216535 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0558.1