MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0131.1 HINFP letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 20 E= 0 0.100000 0.300000 0.250000 0.350000 0.650000 0.050000 0.000000 0.300000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.850000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.100000 0.650000 0.050000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0131.1 MOTIF MA0131.2 HINFP letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 569 E= 0 0.040422 0.597540 0.186292 0.175747 0.489691 0.225086 0.194158 0.091065 0.497297 0.081081 0.390991 0.030631 0.002028 0.787018 0.196755 0.014199 0.000000 0.027559 0.952756 0.019685 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.968825 0.031175 0.000000 0.000000 0.992788 0.000000 0.007212 0.000000 0.059160 0.900763 0.040076 0.002364 0.933806 0.035461 0.028369 0.200000 0.129412 0.442353 0.228235 0.182464 0.199052 0.364929 0.253555 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0131.2 MOTIF UN0557.1 HKR1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 58 E= 0 0.155172 0.189655 0.241379 0.413793 0.448276 0.103448 0.379310 0.068966 0.551724 0.034483 0.275862 0.137931 0.000000 0.000000 0.982759 0.017241 0.137931 0.017241 0.827586 0.017241 0.982759 0.017241 0.000000 0.000000 0.017241 0.000000 0.982759 0.000000 0.017241 0.017241 0.965517 0.000000 0.948276 0.017241 0.017241 0.017241 0.017241 0.827586 0.051724 0.103448 0.810345 0.086207 0.068966 0.034483 0.103448 0.482759 0.137931 0.275862 0.620690 0.103448 0.206897 0.068966 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0557.1 MOTIF MA0043.1 HLF letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.055556 0.222222 0.444444 0.277778 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.166667 0.833333 0.722222 0.055556 0.111111 0.111111 0.000000 0.833333 0.055556 0.111111 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.000000 0.500000 0.000000 0.500000 0.722222 0.222222 0.055556 0.000000 0.833333 0.000000 0.055556 0.111111 0.111111 0.166667 0.055556 0.666667 0.277778 0.277778 0.166667 0.277778 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0043.1 MOTIF MA0043.2 HLF letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2138 E= 0 0.200655 0.343779 0.177268 0.278297 0.387129 0.239892 0.333221 0.039757 0.003262 0.000466 0.000000 0.996272 0.002469 0.015638 0.102058 0.879835 0.865938 0.000000 0.125557 0.008505 0.005037 0.717931 0.011753 0.265279 0.439280 0.023738 0.534233 0.002749 0.018409 0.236193 0.002779 0.742619 0.879835 0.116049 0.001646 0.002469 0.994419 0.000000 0.002326 0.003256 0.049902 0.486837 0.110020 0.353242 0.301216 0.344715 0.168382 0.185688 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0043.2 MOTIF MA0043.3 HLF letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 24424 E= 0 0.278824 0.207296 0.230347 0.283533 0.253480 0.164142 0.257820 0.324558 0.359851 0.181461 0.400958 0.057730 0.012078 0.009908 0.006060 0.971954 0.006633 0.003931 0.036644 0.952792 0.931297 0.005118 0.055028 0.008557 0.008066 0.063380 0.010359 0.918195 0.099001 0.004586 0.888675 0.007738 0.015108 0.704348 0.008148 0.272396 0.989027 0.004995 0.001965 0.004012 0.984892 0.002743 0.007738 0.004627 0.057280 0.541967 0.135113 0.265640 0.364273 0.262529 0.131756 0.241443 0.282591 0.215649 0.226130 0.275631 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0043.3 MOTIF UN0669.1 HLTF letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 51 E= 0 0.313725 0.196078 0.235294 0.254902 0.377358 0.226415 0.094340 0.301887 0.440678 0.559322 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.423729 0.000000 0.000000 0.576271 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.406780 0.084746 0.203390 0.305085 0.000000 0.000000 0.372881 0.627119 0.294118 0.274510 0.274510 0.156863 0.244898 0.244898 0.204082 0.306122 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0669.1 MOTIF MA0895.1 HMBOX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1231 E= 0 0.395613 0.364744 0.157595 0.082047 0.079324 0.444083 0.120936 0.355657 0.053802 0.017934 0.045194 0.883070 0.749695 0.000000 0.223508 0.026797 0.001552 0.039566 0.955004 0.003879 0.020586 0.000792 0.003959 0.974663 0.155308 0.032765 0.005242 0.806684 0.909158 0.002954 0.012555 0.075332 0.501666 0.318454 0.086609 0.093271 0.164094 0.440292 0.300569 0.095045 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0895.1 MOTIF UN0400.1 HMGB15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 1000 E= 0 0.069841 0.082540 0.034921 0.812698 0.695239 0.012698 0.000000 0.292063 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.980953 0.006349 0.006349 0.006349 0.342857 0.082540 0.079365 0.495238 0.206349 0.060317 0.041270 0.692064 0.907937 0.057143 0.022222 0.012698 0.000000 0.003175 0.000000 0.996825 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.273016 0.000000 0.000000 0.726984 0.641270 0.000000 0.228571 0.130159 0.130159 0.060317 0.787302 0.022222 0.009524 0.006349 0.000000 0.984127 0.225397 0.063492 0.019048 0.692063 0.101587 0.063492 0.053968 0.780953 0.253968 0.069841 0.104762 0.571429 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0400.1 MOTIF UN0401.1 HMGB9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1000 E= 0 0.491124 0.100592 0.071006 0.337278 0.287968 0.084813 0.136095 0.491124 0.429980 0.149901 0.106509 0.313609 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.307692 0.000000 0.000000 0.692308 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.211045 0.128205 0.195266 0.465483 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0401.1