MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0183.1 HHEX letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 26 E= 0 0.269231 0.115385 0.076923 0.538462 0.000000 0.269231 0.000000 0.730769 0.000000 0.230769 0.269231 0.500000 0.807692 0.000000 0.076923 0.115385 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.115385 0.115385 0.769231 0.269231 0.000000 0.038462 0.692308 0.846154 0.000000 0.153846 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0183.1 MOTIF MA1390.1 HHO2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 600 E= 0 0.183333 0.058333 0.668333 0.090000 0.493333 0.080000 0.215000 0.211667 0.735000 0.011667 0.076667 0.176667 0.073333 0.146667 0.028333 0.751667 0.150000 0.638333 0.041667 0.170000 0.335000 0.213333 0.213333 0.238333 0.526667 0.151667 0.135000 0.186667 0.815000 0.016667 0.085000 0.083333 0.010000 0.005000 0.840000 0.145000 0.996667 0.003333 0.000000 0.000000 0.028333 0.006667 0.000000 0.965000 0.105000 0.085000 0.043333 0.766667 0.008333 0.991667 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1390.1 MOTIF MA1390.2 HHO2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1538 E= 0 0.256827 0.306242 0.154096 0.282835 0.304941 0.156047 0.282835 0.256177 0.680104 0.084525 0.079974 0.155397 0.944733 0.009103 0.014304 0.031860 0.006502 0.004551 0.877763 0.111183 0.981795 0.002601 0.010403 0.005202 0.024057 0.001300 0.001951 0.972692 0.035761 0.014954 0.009103 0.940182 0.009753 0.986996 0.000650 0.002601 0.100780 0.624187 0.077373 0.197659 0.466190 0.117685 0.189207 0.226918 0.288036 0.154746 0.167750 0.389467 0.328999 0.182055 0.161899 0.327048 0.323147 0.154096 0.194408 0.328349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1390.2 MOTIF MA1386.1 HHO3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0 0.437396 0.068447 0.467446 0.026711 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.974958 0.000000 0.001669 0.023372 0.998331 0.000000 0.000000 0.001669 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.383973 0.616027 0.000000 0.000000 0.010017 0.000000 0.015025 0.974958 0.133556 0.061770 0.078464 0.726210 0.153589 0.524207 0.156928 0.165275 0.275459 0.171953 0.242070 0.310518 0.365609 0.078464 0.257095 0.298831 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1386.1 MOTIF MA1386.2 HHO3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2248 E= 0 0.290036 0.193950 0.138345 0.377669 0.296263 0.237544 0.142794 0.323399 0.345641 0.169484 0.217972 0.266904 0.659253 0.104982 0.077402 0.158363 0.977313 0.005338 0.003559 0.013790 0.000890 0.001779 0.965302 0.032028 0.981317 0.004893 0.004004 0.009786 0.035142 0.000890 0.000445 0.963523 0.030249 0.008007 0.014235 0.947509 0.002224 0.995107 0.001779 0.000890 0.109875 0.171708 0.074288 0.644128 0.302491 0.168149 0.210854 0.318505 0.304270 0.184609 0.150801 0.360320 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1386.2 MOTIF MA1164.1 HHO5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 600 E= 0 0.353333 0.280000 0.095000 0.271667 0.440000 0.165000 0.185000 0.210000 0.506667 0.065000 0.276667 0.151667 0.815000 0.031667 0.048333 0.105000 0.995000 0.000000 0.000000 0.005000 0.000000 0.000000 0.855000 0.145000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.003333 0.000000 0.000000 0.996667 0.023333 0.001667 0.008333 0.966667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.131667 0.388333 0.116667 0.363333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1164.1 MOTIF MA1165.1 HHO6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0 0.727880 0.058431 0.096828 0.116861 0.130217 0.146912 0.006678 0.716194 0.150250 0.626043 0.050083 0.173623 0.352254 0.235392 0.163606 0.248748 0.529215 0.130217 0.158598 0.181970 0.808013 0.025042 0.058431 0.108514 0.000000 0.000000 0.976628 0.023372 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.045075 0.026711 0.000000 0.928214 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1165.1 MOTIF MA1165.2 HHO6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 10595 E= 0 0.251251 0.230580 0.149221 0.368948 0.270882 0.250967 0.148466 0.329684 0.459179 0.153280 0.151770 0.235772 0.537235 0.140916 0.129495 0.192355 0.964700 0.007173 0.010099 0.018027 0.001793 0.003020 0.978386 0.016800 0.982539 0.004908 0.005474 0.007079 0.041057 0.001510 0.001605 0.955828 0.031336 0.006701 0.009910 0.952053 0.004719 0.989523 0.001982 0.003775 0.154601 0.162624 0.081642 0.601133 0.235583 0.167532 0.316376 0.280510 0.305333 0.199906 0.166871 0.327891 0.324776 0.166399 0.164323 0.344502 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1165.2 MOTIF MA0738.1 HIC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 5652 E= 0 0.461076 0.069710 0.404282 0.064933 0.000000 0.023363 0.000000 0.976637 0.083871 0.060102 0.830390 0.025637 0.004667 0.992492 0.002841 0.000000 0.080780 0.908264 0.000000 0.010956 0.299734 0.700266 0.000000 0.000000 0.509608 0.145135 0.263696 0.081562 0.157432 0.449806 0.252914 0.139849 0.155387 0.354120 0.204662 0.285831 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0738.1 MOTIF MA1106.1 HIF1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 980 E= 0 0.201020 0.233673 0.422449 0.142857 0.107143 0.275510 0.268367 0.348980 0.995918 0.000000 0.002041 0.002041 0.000000 0.998980 0.000000 0.001020 0.001020 0.000000 0.998980 0.000000 0.002041 0.033673 0.011224 0.953061 0.085714 0.041837 0.861224 0.011224 0.089796 0.854082 0.020408 0.035714 0.210204 0.295918 0.262245 0.231633 0.167347 0.321429 0.276531 0.234694 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1106.1