MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1210.2 HAT22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 3216 E= 0 0.348881 0.167910 0.168843 0.314366 0.295398 0.245958 0.151741 0.306903 0.112562 0.768035 0.026741 0.092662 0.953358 0.012749 0.006530 0.027363 0.972326 0.007774 0.001866 0.018035 0.017102 0.007152 0.004664 0.971082 0.707711 0.096082 0.096082 0.100124 0.972637 0.004353 0.008085 0.014925 0.016169 0.002799 0.005597 0.975435 0.025808 0.006219 0.024254 0.943719 0.080535 0.028607 0.824005 0.066853 0.348881 0.126244 0.236629 0.288246 0.348259 0.142724 0.188744 0.320274 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1210.2 MOTIF MA0008.1 HAT5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 25 E= 0 0.120000 0.520000 0.160000 0.200000 0.840000 0.040000 0.000000 0.120000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.200000 0.000000 0.800000 0.960000 0.000000 0.040000 0.000000 0.040000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.080000 0.920000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0008.1 MOTIF MA0008.2 HAT5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 19 E= 0 0.052632 0.263158 0.157895 0.526316 0.181818 0.227273 0.136364 0.454545 0.130435 0.565217 0.173913 0.130435 0.916667 0.041667 0.000000 0.041667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.200000 0.000000 0.800000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.187500 0.062500 0.750000 0.000000 0.133333 0.533333 0.266667 0.066667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0008.2 MOTIF MA0008.3 HAT5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 191 E= 0 0.376963 0.167539 0.151832 0.303665 0.418848 0.141361 0.094241 0.345550 0.261780 0.162304 0.104712 0.471204 0.083770 0.774869 0.005236 0.136126 0.994764 0.005236 0.000000 0.000000 0.994764 0.000000 0.000000 0.005236 0.005236 0.000000 0.000000 0.994764 0.701571 0.010471 0.010471 0.277487 0.989529 0.000000 0.000000 0.010471 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.031414 0.000000 0.020942 0.947644 0.068063 0.026178 0.879581 0.026178 0.497382 0.104712 0.157068 0.240838 0.392670 0.078534 0.151832 0.376963 0.324607 0.125654 0.178010 0.371728 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0008.3 MOTIF MA1025.1 HBI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1000 E= 0 0.229000 0.313000 0.229000 0.229000 0.229000 0.229000 0.313000 0.229000 0.132000 0.240000 0.315000 0.313000 0.024000 0.106000 0.762000 0.108000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.904905 0.000000 0.095095 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.021021 0.021021 0.021021 0.936937 0.021021 0.021021 0.936937 0.021021 0.202000 0.485000 0.195000 0.118000 0.226000 0.226000 0.226000 0.322000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1025.1 MOTIF UN0082.1 HCAG_04779 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.250501 0.126253 0.193387 0.429860 0.116116 0.218218 0.516517 0.149149 0.852705 0.122244 0.005010 0.020040 0.009027 0.002006 0.983952 0.005015 0.000000 0.998999 0.000000 0.001001 0.000000 0.998998 0.001002 0.000000 0.002004 0.084168 0.534068 0.379760 0.009027 0.965898 0.002006 0.023069 0.575150 0.151303 0.141283 0.132265 0.279840 0.233701 0.151454 0.335005 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0082.1 MOTIF MA0317.1 HCM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.510000 0.160000 0.250000 0.080000 0.270000 0.080000 0.040000 0.610000 0.663366 0.316832 0.009901 0.009901 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.860000 0.000000 0.130000 0.940594 0.019802 0.019802 0.019802 0.575758 0.171717 0.111111 0.141414 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0317.1 MOTIF MA1369.1 HDG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0 0.298831 0.093489 0.457429 0.150250 0.038397 0.363940 0.000000 0.597663 0.864775 0.111853 0.000000 0.023372 0.667780 0.000000 0.000000 0.332220 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.210351 0.000000 0.000000 0.789649 0.998331 0.000000 0.001669 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.103506 0.006678 0.814691 0.075125 0.278798 0.485810 0.038397 0.196995 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1369.1 MOTIF MA0990.1 HDG11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1001 E= 0 0.208791 0.391608 0.114885 0.284715 0.582583 0.256256 0.067067 0.094094 0.494505 0.026973 0.069930 0.408591 0.057000 0.011000 0.009000 0.923000 0.314685 0.054945 0.032967 0.597403 0.922000 0.028000 0.043000 0.007000 0.833000 0.039000 0.023000 0.105000 0.134865 0.025974 0.000999 0.838162 0.081081 0.025025 0.756757 0.137137 0.220000 0.504000 0.049000 0.227000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0990.1 MOTIF MA1757.1 HDG7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1000 E= 0 0.272500 0.010000 0.452500 0.265000 0.030000 0.902500 0.000000 0.067500 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.790000 0.002500 0.007500 0.200000 0.995000 0.000000 0.005000 0.000000 0.462500 0.000000 0.000000 0.537500 0.010000 0.000000 0.070000 0.920000 0.452500 0.015000 0.395000 0.137500 0.175000 0.382500 0.087500 0.355000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1757.1