>MA0114.3	Hnf4a
A  [  1870   1624      6    211    148      1   5162   5162   5162      0      0    129      0   4452   2148   1019 ]
C  [   587     23      0     14     66   5162      2      0      0      1      5   5162   5162     35   1109   1064 ]
G  [  3292   3538   5162   5162    564      5    159     69     52   5162      7    131      4    709   1121    906 ]
T  [   467      5      1    711   5162    122      0     11      0      3   5162    962    191    135    784   2174 ]
>MA1883.1	Hox1
A  [   284    284    284    271    267    308    344     81     53    860    891     57     59    361    287    268    274    283    287    286 ]
C  [   191    193    193    202    206    202    170     62     49     38     27     31     52    154    221    222    211    207    207    207 ]
G  [   219    221    225    227    213    220    218     76     32     49     31     35     66    240    228    209    208    207    208    206 ]
T  [   305    302    297    300    314    271    268    781    866     54     50    877    823    244    264    301    307    303    299    301 ]
>MA1884.1	Hox3
A  [   338    306    335    348    263    306    293     42    881    964      8     47    801    174    262    394    259    286    350    332 ]
C  [   162    163    183    183    240    229    223     23     19      9     52     63     52    242    236    174    187    177    162    179 ]
G  [   179    181    207    207    200    296    210     17     63     14      9    673     77    214    242    177    153    190    169    160 ]
T  [   321    350    275    262    298    169    274    919     37     13    931    217     71    370    260    256    401    347    319    329 ]
>MA1885.1	Hox4
A  [   298    321    339    346    271    274    334     48    323    934     13     27    936    350    171    249    281    263    286    294 ]
C  [   194    191    194    184    228    224    197     78    598     10     12     29     16    184    292    202    220    224    217    205 ]
G  [   189    196    206    206    218    291    246     33     42     46      8     13     17    209    225    276    211    205    193    190 ]
T  [   319    292    262    264    283    212    223    841     38     10    968    931     30    257    311    273    288    307    304    311 ]
>MA1886.1	Hox5
A  [   296    278    288    290    258    274    245     42    874    944     51     56    171    224    215    248    254    243    252    263 ]
C  [   199    199    203    210    242    224    214     29     25     11     20     53     37    271    242    225    211    204    202    199 ]
G  [   233    235    244    242    236    287    233     19     41     16     35    108    723    265    249    233    212    221    218    217 ]
T  [   272    289    265    258    265    215    308    910     60     28    894    783     70    241    295    294    323    331    328    321 ]
>MA0911.1	Hoxa11
A  [   178    296      1     30    250     14    489    704    704    704    179    139 ]
C  [   108    255     28    704      2      1      3      0     27    159    164    110 ]
G  [   307    704     16      0    704      3     13      2      3    117    150    112 ]
T  [   111      3    704     36      7    704    215     31     40    197    211    343 ]
>MA0650.3	Hoxa13
A  [  5585   4302   1442   1273  14069  15410    105  15804  16813  16550   7635   5256 ]
C  [  3314   4183  12600  14100   1594    243    249    205    125    306   3220   4214 ]
G  [  3868   4557   1889     77    146    666    232    407     98    145   2749   3026 ]
T  [  4481   4206   1317   1798   1439    929  16662    832    212    247   3644   4752 ]
>MA0594.1	Hoxa9
A  [    34     12     38    161      0    101    157    171      5      7    131 ]
C  [    53    110    117      3      0     58      6      1      0    154     11 ]
G  [    81      5      0      8      0      8      0      0      1      0      0 ]
T  [     4     45     17      0    172      5      9      0    166     11     30 ]
>MA0904.1	Hoxb5
A  [    52     27     17     12      1     90     98      1      0     92     19     10     28     28     68     22 ]
C  [    23     35      9     15      7      9      1      0      0      0     29     65     25     44      5     16 ]
G  [    14     19     65     38      0      0      0      1      9      7     41      9     10     11     14     14 ]
T  [    11     19     10     35     92      0      1     98     90      1     11     17     36     17     14     48 ]
>MA0485.1	Hoxc9
A  [   235    112     88    224    661      0    745    881    879     18     48    567    141 ]
C  [   110    171    605    468      3      9     84      0      6      0    715     72    329 ]
G  [   401    536     40      1    205      0     35      0      0      0      5      6    160 ]
T  [   139     66    152    192     16    876     21      4      0    867    117    240    255 ]